Ondanks de vele kleine variaties tussen de Samaritaanse Pentateuch en de Hebreeuwse tekst van het Oude Testament bestaat er een wezenlijke overeenkomst tussen de twee. Zoals eerder opgemerkt zijn de zesduizend afwijkingen van de Masoretische tekst hoofdzakelijk spellingvarianten en cultureel bepaalde woordkeuzen. Negentienhonderd afwijkende vormen sluiten aan bij de Septuaginta (bijvoorbeeld de leeftijden van de aartsvaders in Genesis 5 en 11). Sommige afwijkende vormen in de Samaritaanse Pentateuch zijn sektarisch van aard, zoals het gebod om de tempel op de berg Gerizim te bouwen in plaats van te Jeruzalem (bijv. volgens Exodus 20:17). We moeten echter niet vergeten dat de meeste handschriften van de Samaritaanse Pentateuch jong zijn (dertiende tot veertiende eeuw ) en geen ervan van voor de tiende eeuw stamt. (Archer, SOT, 44) Maar desondanks vormt de Samaritaanse Pentateuch een bevestiging van de tekst waarvan hij vele honderden jaren daarvoor was gescheiden.